Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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