Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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