Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPRL3Q12980 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms