Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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