Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms