Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EP300Q09472 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EP300Q09472 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms