Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms