Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms