Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms