Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms