Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSF1Q00613 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms