Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms