Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms