Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms