Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms