Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEMP55040 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEMP55040 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GEMP55040 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GEMP55040 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEMP55040 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms