Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUCLG1P53597 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms