Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP153P49790 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP153P49790 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms