Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTBP49356 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms