Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPIAP49247 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms