Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRXP46100 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRXP46100 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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