Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms