Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms