Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms