Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms