Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms