Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTX3P26022 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTX3P26022 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms