Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms