Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms