Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A2P16615 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A2P16615 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A2P16615 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2A2P16615 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms