Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms