Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms