Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms