Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC45O75419 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC45O75419 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms