Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms