Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms