Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms