Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLGNO14967 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms