Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms