Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms