Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms