Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms