Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms