Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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