Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms