Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SNX13Q9Y5W8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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