Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms