Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms