Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD7AQ9UPZ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD7AQ9UPZ6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms