Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms